近日,浙江某精准医疗实验室,依托冷冻电镜等先进装备,探索基因诊断、分子分型、细胞和基因治疗等前沿领域。而为突破冷冻电镜所产生的海量数据分析算力瓶颈,中科曙光高端计算解决方案,通过为专业软件部署调优等,确保计算平台好用、易用,助力精准医疗科研工作的顺利进行。
冷冻电镜产生海量数据,传统计算平台力不从心
冷冻电镜,是用于扫描电镜的超低温冷冻制样及传输技术(Cryo-SEM),可实现直接观察液体、半液体及对电子束敏感的样品。在生物医药领域,它能够以接近原子级别的分辨率解析生物大分子及其复合物的三维结构。
借助冷冻电镜技术,许多过去一直面目模糊的蛋白质分子三维结构,现在可看得清清楚楚。这让冷冻电镜成为精准医疗领域重要的科研工具,有助于加深对疾病机制的理解,发现药物靶点、加快药物研发速度等。
然而,随着冷冻电镜等先进科研设备应用,科研数据量呈爆发式增长,传统计算平台在面对如此庞大的数据处理时显得力不从心。
软硬全栈计算方案,突破冷冻电镜算力瓶颈
针对冷冻电镜计算平台的特殊需求,曙光软硬全栈高端计算解决方案,通过为cryosparc live、FOCUS、Warp等系列专业软件部署调优,提供包括数据收集、算力配额管理、远程控制等功能服务,确保计算平台好用、易用,助力科研工作的顺利进行。
此外,曙光还提供了定制化操作系统、LSF作业调度系统以及多种编译环境和数学函数库,为科研人员提供了丰富多样的开发工具。
在硬件方面,曙光为精准医疗实验室搭建了高端计算集群,并配备了分布式并行存储系统,以海量存储空间确保大规模数据集的有效管理。同时,低延迟、高带宽的网络互联进一步提升了计算资源的利用效率,高效解决计算平台对海量医疗数据大文件存储场景高IOPS等需求。
曙光高端计算解决方案,有效提升了生命健康科研部门对海量数据的处理能力,高效助力系统医学与精准诊治实验室完善多组学分析平台,加速精准医疗成果走出实验室。